O filme se passa durante a série Digimon Adventure e Digimon Adventure 2.
No começo aparece Tai e Kari, eles recebem um digiovo do seu computador.
Do digiovo, nasce Greymon que começa a destruir a cidade, então aparece um Digimon desconhecido.
Greymon destrói esse Digimon e desaparece.
Então eles vivem sua primeira aventura.
Depois muito tempo se passa, um dia Tai e Izzy descobrem que um
Vírus Digimon está destruindo a internet e logo destruira o mundo.
Tai com a ajuda de Matt, destróem o Vírus Digimon, ou pelo menos é o que parece.
O Vírus Digimon, toma o corpo de um outro Digimon, depois de um tempo, TK e Kari descobrem o Digimon e precisam dete-lo. Nessa versão do filme aparece um digiescolhido americano, Willis, que nunca teve contato com outro digiescolhido. Willis desperta ciúmes de Davis, que é apaixonado por Kari.